Нуклеиновые кислоты, От А до Я, Аппель Б., Мюллер С., 2013

В-ДНК.
Наиболее стабильная в физиологических условиях двухспиральная правозакрученная структура с антипараллельной ориентацией цепей, которая образуется ДНК случайной последовательности (также называемая уотсон-криковской спиралью). В-ДНК, вместе с С- и D- формами принадлежит В-семейству. Ось спирали в В-ДНК проходит почти через центр пар оснований (смещение пар в сторону большого желобка составляет —0,2 А), которые располагаются практически перпендикулярно к оси с небольшим отрицательным наклоном — 6°. Большой и малый желобки имеют примерно одинаковую глубину. На виток спирали в В-форме приходится 10,5 пар оснований (в растворе); в кристаллическом состоянии порядок спирали составляет 10 пар из-за ограничений, обусловленных кристаллической упаковкой.

Расстояние между основаниями вдоль оси спирали составляет 3,4 А, а расстояние между фосфатными группами одной цепи — 7 А. Для В-ДНК характерна систематическая модуляция структуры, зависящая от нуклеотидной последовательности, которая включает изменение углов спирального вращения и крена пар оснований, а также вариации в значениях торсионных углов сахарофосфатного остова. Преобладающая конформация фуранозного цикла — С2'-эндо или близкая к ней С3'-экзо. В-форма двойной спирали является основной биологически значимой вторичной структурой ДНК, которая сохраняется и тогда, когда ДНК обвивает гистоновый кор нуклеосом.

Купить книгу Нуклеиновые кислоты, От А до Я, Аппель Б., Мюллер С., 2013 .